Ze względu na objaw dominujący wyróżnia się trzy podstawowe typy choroby:

 

IBS-C (irritable bowel syndrome with constipation)	postać zaparciowa	co najmniej przy co czwartym wypróżnieniu twarde lub brylowate stolce oraz luźne lub wodniste stolce rzadziej niż przy co czwartym wypróżnieniu
IBS-D (irritable bowel syndrome with diarrhea)	postać biegunkowa	luźne lub wodniste stolce przy co najmniej co czwartym wypróżnieniu oraz twarde lub brylowate stolce rzadziej niż przy co czwartym wypróżnieniu
IBS-M (mixed diarrhea and constipation)	mieszana postać choroby	twarde lub brylowate stolce przy co najmniej co czwartym wypróżnieniu oraz luźne lub wodniste stolce przy co najmniej co czwartym wypróżnieniu

 

Dodatkowo, oprócz typów choroby opisanych w tabeli, występuje zespół jelita drażliwego z dominującym bólem lub z dominującymi wzdęciami, a ok. 10% pacjentów choruje na poinfekcyjną postać zaburzenia, występującą w wyniku przebytego zakażenia jelitowego.

 

W niektórych opracowaniach spotkać można także oznaczenie IBS-U, oznaczające nieokreśloną postać zespołu jelita drażliwego, w której nie stwierdza się wystarczających nieprawidłowości w konsystencji stolca aby mogły być spełnione kryteria IBS-C, IBS-D, IBS-M.